整地是作物播种或移栽前进行的一系列土壤耕作措施的总称。其目的是创造良好的土壤耕层构造和表面状态，协调水分、养分、空气、热量等因素，提高土壤肥力，为播种和作物生长、田间管理提供良好条件。在中国，整地的主要作业包括浅耕灭茬、翻耕、深松耕、耙地、耢地、镇压、平地、耖田、起垄、做畦等。
黄连的整地主要就是指翻耕、耙地、做畦。翻耕是用有壁犁翻转耕层和疏松土壤，并翻埋肥料和残茬、杂草等的作业。是整地作业的中心环节。耙地是翻耕后用各种耙平整土地的作业。耙深4~10厘米，用圆盘耙、钉齿耙等耙地，有破碎土块、疏松表土、保水、提高地温、平整地面、掩埋肥料和根茬、灭草等作用。翻耕后耙地分干耙和水耙。干耙能碎土；水耙能起泥浆和平地、使土肥相融。做畦有利于灌溉和排水。分为平畦、高畦。用做畦机、犁、锹、铲等进行做畦。
在整地之前先选好缓坡地，缓地有利于排水，但坡度不宜超过30度，坡度过大，冲刷严重，水土流失，黄连存苗率低，生长差，产量低，地面坡度选择为20度以内就可以。砍除杂草和不需要的条木烧炭做肥，再把地表的残渣及石头等杂物清除出棚外，堆成堆，熏烧成黑土，为翻地做好准备。
生荒地栽种黄连和杂木林林间栽种黄连的整地方法基本相同。首先粗翻土地，深13~16厘米，挖净浅层土地里的草根、竹根，拣净石块等杂物，应分层翻挖。然后深翻土地 23厘米左右，整细耙平。在深挖时要注意防止将表层腐殖质土翻到下层，并且注意不能伤根太狠，尤其是靠近上坡的树根一定要保留，否则树容易倒伏。
之后要在棚的周围开好排水沟，顺着坡向做宽130-150厘米，高约10厘米的高哇，沟宽16~26厘米，也可以做沟宽约30厘米的高畦，面呈弓背形，畦面平整，并保证没有碎石、树根，土细，每公顷施腐熟牛、马粪15000~22500千克，将其捣碎均匀铺于畦面，然后浅挖，与表土拌匀，还可以覆盖些熏土。
熟地的翻地与生荒地和林地的翻地有所不同。每亩地施基肥4000~6000千克，浅翻人土，深度在10厘米左右就可以，不需要深翻，把地耙平之后就可以做高畦了。做畦前应根据地形开好排水主沟，使水流畅通，不致冲垮厢畦。-般主沟宽50~60厘米，深度大约30厘米，如果搭建的木棚比较大、坡陡，排水主沟应宽些、深些。
耕种帮提醒主沟要直，尽量避免弯曲。根据排水主沟情况做畦，畦宽1.2米，沟宽约30厘米，沟深约10厘米，畦面要求成瓦背形。畦的长度根据地形而定，一般每隔8~10米要开宽约30厘米的横沟，横沟应斜着开，终点应该连接排水主沟，做畦后要在棚的上方与两侧开护棚排水沟，防止棚外水流入棚内。
在耙好地之后就可以播种黄连了。
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