小檗碱属于异喹啉类生物碱，对真菌性病害有显著的防治效果，主要是通过渗透作用干扰病原体的代谢而起到抑制生长和繁殖的作用；对细菌性病害也有一定的防效，可以破坏细菌表面结构，导致细胞内钙离子和钾离子外流，造成细菌内环境破坏，从而导致细菌生长被抑制。
小檗碱主要登记作物病害有：猕猴桃褐斑病、番茄灰霉病、辣椒疫霉病等。
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